Curtea de Conturi a publicat un raport critic la adresa ANSVSA, vizând atât instituția centrală, cât și cele 45 de entități din subordinea sa, inclusiv 42 de direcții județene și trei institute naționale. Auditorii au emis o „opinie contrară”, cel mai sever tip de evaluare, semnalând că datele financiare nu reflectă realitatea. Problemele identificate includ erori contabile majore, datorii neînregistrate și deficiențe grave în controlul intern și în procesele de achiziție.
Una dintre cele mai grave probleme vizează evaluarea patrimoniului, unde imobilele și terenurile au fost supraevaluate cu peste 22 de miliarde de lei. Această eroare masivă a fost cauzată de un program informatic care actualiza automat valorile în funcție de inflație, ignorând regulile de reevaluare. În timp ce la DSVSA Ilfov valorile erau prea mari, în alte județe clădirile erau înregistrate la valori prea mici deoarece nu fuseseră reevaluate de mult timp.
Raportul evidențiază și discrepanțe între contabilitatea instituției și sistemul național de raportare, la un capitol de peste 52 de milioane de lei. De asemenea, ANSVSA nu a înregistrat în evidențe suma de 1,7 milioane euro, echivalentul a aproximativ 8,7 milioane de lei, provenită de la Comisia Europeană pentru programe veterinare. Totodată, au fost identificate datori și neînregistrate, precum cele de aproape 11 milioane de lei pentru servicii prestate în a doua jumătate a anului 2024.
Un caz de o seriozitate extremă a fost identificat în Vrancea, unde s-au plătit despăgubiri pentru 996 de porci care nu figurau în evidențele fermei. În timp ce documentele indicau un efectiv de 20.328 de animale, despăgubirea a fost calculată pentru 21.324 de porci. DSVSA Vrancea nu a solicitat explicații pentru această diferență, iar auditorii au găsit și alte plăți nejustificate, precum 270.948 de lei pentru carne confiscată sau 234.818 lei pentru medicamente distruse.
În zona achizițiilor, Institutul de Igienă și Sănătate Publică Veterinară din București a plătit aproape 900.000 de lei pentru lucrări suplimentare de renovare, fără a organiza o nouă procedură de achiziție. La DSVSA Prahova, un antreprenor a decontat o cantitate de cărămizi cu 43 de bucăți mai mare la metru cub decât cea utilizată, generând o plată suplimentară de peste 34.000 de lei. Alte plăte scurte au fost identificate la DSVSA Argeș și DSVSA Vâlcea.
Controlul intern al instituției a fost descris ca fiind deficient, având în vedere că departamentul IT propriu a fost înființat abia în 2025 și dispunea de un singur angajat. Curtea de Conturi a impus măsuri de remediere, inclusiv recuperarea sumelor și clarificarea procedurilor de reevaluare a patrimoniului. Termenul limită pentru rezolvarea tuturor problemelor identificate de auditori este stabilit pentru data de 31 decembrie 2026.